須知，玄天上帝是道教神仙譜系中，掌管北方的大神，同時祂也被譽為大明帝國的護國神明。
「國姓爺」鄭成功則在台灣建立政權后，曾吸納大量明朝遺臣為下屬，並且高舉「反清復明」的旗幟與清朝對抗，因此後港斗母宮與「反清復明」的故事似乎隱約有點聯繫。
再者，該廟正殿前方有一副對聯：「日昍晶𣊭弄里羨慕，月朋𦜳朤定乾坤。
」對聯開頭數個字分別以「日」和「月」為主，「日」、「月」合在一起就是「明」，因此有學者認為這副對聯其實是一幅「反清復明」的旗幟。
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後港斗母宮的祖廟是位於檳城的香港巷斗母宮，該廟已故李茂盛道長曾說，該對聯的讀音是：「日月精華龍里羨，月朋浪蕩定乾坤」。
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